康复治疗学（物理治疗方向）专业大学本科，学制四年，授予理学学士学位。
（隶属康复医学院）培养目标旨在培养具有良好的职业道德和较强的沟通能力，较扎实的基础医学和临床医学基本知识和技能，系统掌握康复治疗学基础理论及常用的功能评定技术，具有一定的临床思维能力、较强的创新和物理治疗实践技能的合格物理治疗师。
主要课程功能解剖学、骨科疾病物理治疗、小儿神经系统疾病物理治疗、成人神经系统疾病物理治疗、物理因子疗法、心肺系统疾病物理治疗、训练与运动学、物理治疗从业基础等。
专业特色该专业是通过手法治疗辅以物理设备来帮助恢复人体各项功能的专业。
我校是目前国内为数不多的开设物理治疗学专业的院校之一，与香港、台湾、美国、丹麦、德国等国内外知名康复机构建立长期的密切合作关系。
专业课程理论与实践课课时比例为1:2。
实训条件居国内领先地位，是省级实践教学示范中心、省级人才培养模式创新实验区。
作为中医药院校开设的物理治疗学专业，注重针灸、推拿、功法等传统康复技能的培养。
福建中医药大学附属康复医院作为国家临床康复重点专科医院是培养我省康复人才的重要临床见实习基地。
就业方向毕业生就业面向各级综合性医院康复科、康复专科医院、老年病医院、社区卫生服务机构、保健康复机构和体育运动机构，从事包括神经系统疾病、骨骼肌肉系统疾病、心肺系统疾病、老年性疾病等的物理治疗，运动保健与评定，康复治疗的教学和研究等工作。
康复治疗学（作业治疗方向）专业大学本科，学制四年，授予理学学士学位。
（隶属康复医学院）培养目标旨在培养具有良好的思想品质和职业道德，系统掌握作业治疗基础理论知识与技能的作业治疗师。
同时，注重培养作业治疗师临床工作的思路和技巧，能将作业治疗评定方法和各项作业治疗操作技术在人、环境、作业层面熟练运用。
主要课程作业治疗基础理论、矫形器学、职业康复学、环境改造学、神经系统疾病作业治疗、骨骼肌肉疾病作业治疗、内科及老年病作业治疗、儿科疾病作业治疗、社会心理作业治疗等。
专业特色作业治疗是一种针对短暂或永久性身体、心理、行为、智力、社交方面的残障人士的康复治疗专业。
通过具有治疗性质的活动，作业治疗使残障人士提高全人发展能力，帮助接受治疗人士掌握所需生活技能，协助他们重返家庭、重回工作岗位、重新投入社群生活，以实现独立、有意义和丰富的人生。
我校是目前国内为数不多的开设作业治疗学专业的院校之一，，与美国、丹麦、德国等国内外知名康复机构建立长期的密切合作关系，通过本地及海外的教学交流活动，培养学生国际视野，了解世界各地的作业治疗发展情况。
作业治疗专业课程理论学习与临床实践并重，专业课程理论与实践课课时比例为1:2，实训条件居国内领先地位，是省级实践教学示范中心、省级中医康复人才培养模式创新实验区。
作业治疗采用专业多元化考评制度，依据具体的教学情况对学生进行考核，考核方式由笔试、操作考试、小组报告、学习笔记、平时成绩等几部分组成，评分标准涉及行为举止、语言表达、动作规范、诊疗程序、治疗计划等多个方面。
就业方向毕业生就业面向各级综合性医院康复科、康复专科医院、老年病医院、社区卫生服务机构、保健康复机构和体育运动机构，从事包括神经系统疾病、骨骼肌肉系统疾病、心肺系统疾病、老年性疾病等的临床作业治疗，以及康复医学院校、研究所的教学和研究等工作。